基因检测领域研究最新进展
随着科研领域技术的不断发展，多种新的基因检测方法不断涌现。无数人关心着这个新兴领域的市场发展动态。
基因检测用于乳腺癌患者预后评估
随着早期筛查的开展，无痛肿瘤发病率不断上升，但无痛肿瘤的识别方法还很有限。近日研究人员考察了多基因分类手段在女性无痛浸润性乳腺癌早期筛查的应用。
本次研究是他莫昔芬与无全身治疗的随机对照临床试验的二次分析，随访超过20年。在缺少全身治疗的情况下对参与者进行MammaPrint70个基因表达分析以预测患者15年后的死亡风险。研究的主要终点是对治疗，患者年龄、诊断时间、肿瘤大小、分级、激素受体、Ki67和ErbB2/HER2状态调整后的乳腺癌特异性生存率。
研究包含了名患者的MammaPrint评分，患者平均年龄62.8岁。分别有人(58%)以及(42%)名患者MammaPrint评分为低风险或高风险。20年后的Cox分析发现，70基因检测高风险以及低风险患者，比对于非超低风险患者其肿瘤特异性死亡风险高(高风险HR，4.73[95%CI，1.38-16.22]，低风险HR，4.54[95%CI，1.40-14.80])。超低风险并且服用他莫昔芬的妇女15年内无死亡病例且20年的生存率97%，而超低风险未服用它莫西芬妇女生存率为94%。超低风险是预后良好的最显著预测因子；非超低风险患者，肿瘤体积大于2厘米是预后效果的最佳预测因子。
研究表明，70基因MammaPrint检测超低风险患者，单凭手术后乳腺癌死亡的长期系统性风险非常低。
例样本证实，患癌风险≈精准基因突变+家族史
6月21日，剑桥大学科学家在《美国医学会杂志》（JAMA）上发表了一项大样本队列研究报告，分析包括了近1万名BRCA1或BRCA2基因突变的妇女，评估了突变携带者发生乳腺癌、卵巢癌、对侧乳腺癌的年龄相关风险，旨在预估有这些基因突变的女性罹患乳腺癌或卵巢癌的年龄特异性风险。
研究人员建议，这些研究结果应该对医生在给出治疗方案和改变不良生活方式的建议和咨询方面有所帮助。该研究的主要作者、来自剑桥大学公共卫生和基础保健部门AntonisAntoniou教授表示，“我们已经能够提供不同年龄层的风险，最精确的估计的日期，这些措施将有助于对BRCA1和BRCA2基因缺陷妇女的咨询和临床管理提供更多的信心。”
一个基因变异增加五种心血管疾病风险
近日，美国、荷兰和德国科学家表示，人类第6号染色体上的一个基因变异能增加冠心病等5种血管疾病的风险。这一发现将有助于开发针对这些疾病的新的防治方法，相关研究发表于新一期《细胞》杂志。
此前研究发现，第6号染色体上某个区域的变异与5种血管疾病有关，包括冠心病、偏头痛、高血压、颈部动脉夹层和纤维肌发育不良。新研究定位到了具体的遗传代码，并发现了它增加血管疾病风险的原因。
美国哈佛大学等机构的研究人员综合多个项目的大规模调查数据，分析了数十万人的相关信息，找到了这个核心变异。它是DNA（脱氧核糖核酸）代码单个核苷酸“字母”的变化，位于一段非编码区。这类区域不指导蛋白质合成，但能调节基因活跃程度。
研究人员通过精细遗传定位，找到了rs位点。该位点位于PHACTR1基因第三内含子中，是一个常见的单碱基突变位点。来自人体组织的表观遗传学研究发现，rs特异性地在主动脉中表现出增强子特征。因此，该单碱基突变可能具有基因表达的调节功能。CRISPR编辑的干细胞衍生的内皮细胞证明，rs具有调节内皮素1（EDN1）表达的功能。EDN1是位于PHACTR1上游kb的基因。EDN1对脉管系统的已知生理作用可能解释了rs突变引起多种血管疾病的原因。
这个变异部位与EDN1基因的距离很远，但活动却密切相关，是基因远距离调控的又一个例证，将有助于多种血管疾病发病的生物学机制研究。
基因变异实例
卵巢透明细胞癌约占美国卵巢癌的5％至10％，但在亚洲卵巢癌患者中会高达20％，在卵巢癌致死原因中排第二位。这种类型的卵巢癌对铂类药物的化疗不敏感，让治疗比较困难。以前的研究表明，一种名为ARID1A的染色质重组蛋白与这类卵巢癌有关。当它正常时，能通过改变染色质结构来调控一些基因的表达，最近的研究表明，在超过50%的卵巢透明细胞癌病例中，ARIDIA都有突变。ARID1A和抑癌基因p53的突变有互斥性，也即是说有ARID1A突变的患者不会具有p53突变。但即使p53没有突变，它本该保护基因组完整和控制细胞凋亡的功能还是不正常，因为这些患者的疾病仍然预后不良。
在这项来自TheWistarInstitute的研究中，华人张如刚教授带领的研究组研究了ARID1A和组蛋白脱乙酰酶（HDACs）之间的关系，发现HDAC6的活性对于具有ARID1A突变的卵巢癌至关重要。他们发现，HDAC6通常被ARID1A抑制，而在ARID1A突变的情况下，HDAC6的水平会升高。因为HDAC6能抑制p53的活性，HDAC6升高后就抑制了p53的肿瘤抑制功能，因此，HDAC6水平的上调有助于肿瘤的生长和扩散。
张教授实验室利用小分子药物rocilinostat对ARID1A突变型癌症的HDAC6进行选择性抑制，发现这药物能够在含有ARID1A突变的肿瘤细胞中提高细胞凋亡。这与在携带ARID1A突变卵巢肿瘤的动物模型中观察到的肿瘤生长减缓，腹膜扩散被抑制和生存期延长是相关的。
“我们证明了使用rocilinostat这类选择性抑制剂，通过靶向抑制HDAC6活性来治疗卵巢透明细胞癌和其他受突变ARID1A影响的肿瘤，这种治疗策略是可行的，”论文的共同第一作者ShuaiWu博士说，“我们在这项研究中使用的抑制剂已经在临床试验显示了很好的耐受性，所以这个研究结果可能会对卵巢癌治疗有深远的影响。”这篇论文发表在7月24日的《NatureCellBiology》上。
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